Laboratorium Klinik Kimia Farma saat ini sudah merambah pada pemeriksaan biomolekuler yang pada saat ini sedang berkembang di dunia laboratorium. Adapun pemeriksannya menggunakan metode PCR (polimerase chain reaction).
Beberapa pemeriksaan Khusus yang dapat dilakukan di Laboratorium Kimia Farma diantaranya adalah:
1. HBV DNA Kuantitatif
2. HCV RNA Kuantitatif
Selain yang disebutkan diatas tersedia pula pemeriksaan kultur dan Resistensi